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基于galaxy的16s rRNA和宏基因组分析

环境搭建

docker run -d -p 8080:80 quay.io/galaxy/introduction-training

在浏览器中打开http://localhost:8080。以管理员身份登录（账号：admin@galaxy.org，密码admin）。

安装tools。依次点击Admin > Install new tools > Browse valid repositories > 搜索所需工具 > install > install to galaxy > 在add new tool panel section输入mothur（相当于新建工具文件夹） > install。

参考资料

[01]. 16S Microbial Analysis with Mothur

[02]. Analyses of metagenomics data - The global picture

[03]. Metagenomics standard operating procedure v2

[04]. 可视化生信分析利器-Galaxy（第一讲）